据世界经济学人报道http://economist.icxo.com讯，马英九题目订为“人民奋起，台湾新生”的就职演说重点有二：第一，他愿意发展两岸关系，但希望大陆给予台湾更多国际空间；第二，他提“中华民国与台湾的命运已经紧密地结合在一起”，为“中华民国就是台湾”的台湾论述预留伏笔。
《中国时报》分析文章说，先就两岸关系来看，马英九显然是从更大的美中台三角关系来思考，不是单独考虑两岸互动。众所周知，美方希望两岸复谈，但不乐见两岸过热，加上马英九也有反对党压力，因此马当选后很早就拍板，未来不会是一片“中国热”。
胜选当天，马英九表达希望访美日的强烈期盼，但同时也请国民党主席吴伯雄访中，平衡美中台三边关系。后来马拍板先由萧万长赴博鳌论坛，但萧返国后，马有意降温，又传出赖幸媛人事案，一拉一收，马意在全盘掌握。
胡锦涛与连战会面提出“建立互信，搁置争议，求同存异，共创双赢”十六字箴言，马英九在就职演说回应，字字句句都有下功夫，有软有硬，试图找寻对内（蓝绿）、对外（美中）的平衡点。
首先，马善意响应胡锦涛，表达愿意在“九二共识”基础下恢复协商，他也呼应了胡锦涛定调的“两岸历史新契机”用语。台联主席黄昆辉与马会面后，要求马“少提九二共识、多提一中各表”，马虽口头表示同意，但却未见诸就职演说，避免了对岸不快反应。
马也以“坚持开放、大幅松绑、释放民间的活力、发挥台湾的优势”，对他未来两岸政策定调。此外包括在就职演说中新增，对四川大地震的关心等柔性喊话，也都有加乘效果。
但马英九也反过来呼吁，两岸今后不管在台湾海峡或国际社会，都应该“和解休兵”，并且在国际组织、国际活动中，“相互协助、相互尊重。”这就软中带硬，将了大陆一军，把球丢回给胡锦涛，挑明希望大陆放行国际空间，让台湾进ＷＨＯ等国际组织，不要再一味打压。
由此可见，马英九的两岸战略，还是以台湾主体性为基础的思考。核心幕僚强调，马就职演说特别着墨的部分是“台湾论述”，也意在言外。马以中华民国在台湾的时间，远远超过在大陆的时间，巧妙地为“中华民国就是台湾”论述铺了路。
在就职演说最后，马英九再次强调，会秉持台湾精神，坚持“以台湾为主，对人民有利”原则来建设台澎金马，即为最关键的脚注。马特别引布什盛赞台湾民主成就的字句，向全球华人宣扬“台湾是亚洲和世界民主的灯塔”，让主轴回归台湾主体；字句不算强势，却相当坚持，也向对岸释放了足够清晰的讯息。
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